Le film a été tourné principalement au Royaume-Uni, mais aussi au Canada. Compte tenu du genre, du nombre d'effets spéciaux et des lieux fortement destructibles, de nombreuses scènes ont été tournées en studio, pour lequel le studio londonien Pinewood a été choisi. 

Lieux de tournage :

Le Vide

Au cinéma

Scène où Wolverine et Deadpool tombent dans le Vide, où ils commencent à se battre. Après le combat, les mutants de Cassandra Nova arrivent et ils sont obligés de s'échapper en combattant...

Dans la réalité

La scène a été tournée dans la réserve naturelle de Pitstone Hills, au nord-ouest de Londres. Cet endroit possède un grand plan d'eau artificiel avec une route sablonneuse et une végétation clairsemée autour, ce qui convenait parfaitement au tournage de la scène.