Film ini difilmkan di Paris, Washington, Los Angeles, Praha, dan beberapa kota di Republik Ceko. 

Lokasi syuting:

Gedung Putih

Di film

Adegan di mana Presiden AS diberitahu bahwa teroris telah merebut hulu ledak rahasia.

Di dunia nyata

Adegan ini difilmkan di Gedung Putih yang sebenarnya di Washington, sudut pandang diambil dari sisi utara gedung.

Laboratorium DeCobray

Di film

Adegan di mana G.I. Joe tiba di laboratorium DeCobray.

Di dunia nyata

Adegan ini difilmkan di Prancis, di Paris di Avenue du Maréchal Gallieni. Di latar belakang terlihat atap istana besar, yang terletak di seberang Jembatan Alexander III.

Ular di mobil

Di film

Adegan di mana Snake Eyes mencoba bertahan di atap Hummer teroris.

Di dunia nyata

Adegan ini difilmkan di dekat Arc de Triomphe, Paris, Prancis.