Uma jovem concha chamada Marcel vive com sua avó em uma casa humana. O divórcio dos antigos donos afetou profundamente os pequenos habitantes: a maior parte da família, escondida em uma caixa de meias durante a briga, acidentalmente caiu em uma mala e foi para um destino desconhecido. O maior sonho do jovem é encontrar seus parentes, e para isso ele contará com a ajuda do cineasta iniciante Dean, que decide fazer uma reportagem sobre os pequeninos.

"Marcel, a Concha com Sapatos" é um filme cujos primeiros esboços nasceram em 2010. Tudo começou quando a jovem escritora e atriz Jenny Slate, junto com seu amigo e diretor Dean Fleischer-Camp, decidiu filmar alguns vídeos sobre o jovem de sapatos rosa choque e publicá-los no YouTube. Os curtas rapidamente encontraram seu público, mais tarde se tornando a base para a criação de uma série de livros infantis.

Onze anos depois, é lançado um longa-metragem sobre o personagem, filmado no formato de falso documentário com animação stop-motion. A escolha do gênero se explica não apenas pelo desejo de se adequar ao original, mas também pela tentativa de mostrar mais detalhadamente os detalhes do mundo familiar sob a ótica de uma pequena concha. A primeira metade de "Marcel" consiste em uma entrevista na qual o jornalista pergunta à criança sobre as peculiaridades de seu dia a dia. Andar em uma bola de tênis, assistir ao programa de TV favorito com a avó e participar das filmagens do documentário criam um quadro de infância sem preocupações, fazendo o espectador sentir nostalgia.

O caráter autobiográfico de "Marcel" reside não apenas no roteiro, construído em torno das filmagens de um projeto documental, mas também nos personagens principais, interpretados pelos criadores da imagem. Ao aproximar o mundo da tela da realidade, os autores traçam um retrato fiel de um cineasta que decidiu compartilhar suas próprias paixões, mas inesperadamente ganhou popularidade na internet. "Marcel" se torna uma declaração de que, no mundo moderno, praticamente qualquer pessoa pode fazer cinema, desde que tenha uma ideia original e equipamento de qualidade.

Os criadores também mostram algumas desvantagens da fama. Apesar do respeito dos fãs, Marcel nunca recebe ajuda deles para encontrar seus parentes. Ao saberem do local de moradia da criatura, os fãs começam a tirar fotos perto de sua casa e a fazer barulho, perturbando sua paz. O garoto precisa rapidamente abandonar suas antigas crenças sobre a bondade das pessoas e entender que o mundo não se limita à sua casa e arredores próximos.

A avó de Marcel também é uma personagem-chave – a mulher com quem a criança passou a maior parte da infância. Uma piora inesperada na saúde da idosa ocorre no pior momento: os criadores do programa de TV favorito da família se oferecem para gravar um episódio sobre o neto. O medo de perder seu parente próximo coloca a criança diante de um dilema: aceitar as filmagens, deixando estranhos entrarem em casa, ou esperar até que a saúde da avó melhore. A segunda metade do filme é um drama social sobre a importante escolha de vida de uma criança que não se sente segura em seu próprio território.

A idosa, por sua vez, tenta de todas as formas promover a criança na TV, pois entende que essa é a única maneira de reencontrar os membros da família. São os repórteres do programa "60 Minutos" que realizam o desejo do jovem, reunindo os parentes sob o mesmo teto. No entanto, o encontro não ocorre sem perdas. Com o final do filme, os criadores enfatizam a importância de passar tempo com os entes queridos, sugerindo que a comunicação familiar é a maneira mais segura de deixar os eventos do passado para trás.